Με τη νέα σύνθεση της Ειδικής Μόνιμης Επιτροπής Περιφερειών της Βουλής η Άννα Βαγενά είναι η μόνη βουλευτής που εκπροσωπεί τον νομό Λάρισας, γεγονός το οποίο η ίδια χαρακτήρισε «μεγάλη ευθύνη» στην τοποθέτησή της στη συνεδρίαση της 27ης Μαρτίου 2018 με ημερήσια διάταξη τον προγραμματισμό των εργασιών της επιτροπής.
Η βουλευτής αναφέρθηκε επιπλέον σε ζητήματα που θεωρεί μείζονα για την ευρύτερη περιοχή της Θεσσαλίας, δηλαδή τη διαχείριση των υδάτινων πόρων (εκτροπή Αχελώου, κατολισθήσεις, πλημμύρες, ξηρασία κ.α.), καθώς και το Θεσσαλικό Θέατρο στο πλαίσιο της αναμόρφωσης του θεσμού των ΔΗ.ΠΕ.ΘΕ.
Τέλος, επιφυλάχτηκε να φέρει προς συζήτηση στην επιτροπή και άλλα θέματα κατόπιν συνεννόησης με τοπικούς φορείς.